Comandos para subir un repositorio a GitHub, el repositorio debe existir en GitHub, podemos crearlo por la web. 

git init

git add .

git commit -m "first commit"

git remote add origin https://github.com/NOMBRE_USUARIO/NOMBRE_PROYECTO.git

git push -u origin master

Para identificarnos en GitHub necesitaremos un token, lo podemos obtener, desde nuestra cuenta de GitHub:

Generamos un token

Para acceder solo necesitamos nuestro nombre de usuario y el token

$ git clone https://github.com/username/repo.git
Username: your_username
Password: your_token